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英木和

概述
DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics) Bio-IT生物信息分析平台是全球首款专门用于分析NGS数据的处理器,其超强的性能可以将基因组数据处理缩小到一块芯片上,装在一个台式电脑那么大的服务器中。DRAGEN问世后被著名生命科学期刊《科学家》(The Scientist)评为2014年全球十大创?#24405;?#26415;的第一名。
系统
极速
FPGA将算法实现于逻辑电?#20998;校?#21487;即时完成计算,输出结果。因此,DRAGEN可在20分钟内完成一个人类基因组的30X序列分析,而使用传统的以CPU为基础的系统,则需要至少20小时才能完成。


精准
DRAGEN的设计充分考虑了如何消除偏好及其他来源的误差,确保全面保持高精度。目前DRAGEN流程中已包含检查和校准以提升结果可靠性,如GC偏好校正。在最近一期Precision FDA变异识别挑战的六项精度指标中,DRAGEN获得了五项第一。


灵活
本地和云端的解决方案使用户非常方便得到DRAGEN的服务。用户可以在本地部署,也可以选择我们在云端服务领域处于领先地位的?#29486;?#20249;伴,还可以在两者间安全传输数据,使用两者相结合的混合云。


节省
一台DRAGEN设备可以替代80台传统计算设备,降低本地部署投入。整合G3压缩技术,DRAGEN可以有效压缩用户数据,降低数据存储成本。


参数

基于FPGA技术的DRAGEN引擎

DRAGEN引擎能有效解决大数据基因组学两个关键的需求——计算和存储。DRAGEN为所有重要的基因组学应用提供了可扩展、超快速和低成本的二级分析解决方案,并为基因组数据提供高效率的存储机制。
DRAGEN平台提供的超快速计算和高效存储能力源于核心FPGA技术。由于FPGA具有高度可重构的特性,DRAGEN可以根据需要随时重新编程,可以在线无缝完成算法的切换更新。这?#33267;?#27963;性使Edico Genome公司能?#20013;?#23436;善改进DRAGEN平台,定期发布新版本供用户下载。


F1?#21697;?#26696;

云端DRAGEN服务目前由亚马逊云平台(Amazon EC2) F1?#21697;?#26696;承载。得益于Xilinx公司强大的Virtex UltraScale+FPGA架构,F1?#21697;?#26696;有能力以?#24067;?#21152;速方式完成包括NGS在内的各类大数据处理。将Edico Genome公司基于FPGA的DRAGEN Bio-IT平台部署在F1?#21697;?#26696;上,可为用户提供精确、快速、灵活和低成本的云端DRAGEN服务。


流程
应用

DRAGEN胚系分析流程V2+
DRAGEN胚系分析流程V2+ 提供临床级别从BCL转化至VCF的全程NGS分析,同时包含先进的误差模型校准机制,以有效提升精确性。


DRAGEN体细胞分析流程V2
DRAGEN体细胞分析流程包含肿瘤以及肿瘤/正常两种模式,用于检测肿瘤样本中的体细胞变异。


DRAGEN RNA基因融合检测流程
DRAGEN转录组分析流程始于剪接点的发现和比对,进而完成基因融合检测。
 
DRAGEN联合基因分型和群体识别流程
DRAGEN联合基因分型流程算法可以在多基因组比对中识别变异,即便同时处理上千样本也能快速完成、确保精确。


DRAGEN拷贝数变异分析流程
DRAGEN拷贝数变异(CNV)分析流程可为胚系、体细胞的外显子以及基因组完成拷贝数变异分析。在最终给出识别结论前,该算法可应用不同级别的过滤器有效降低误报。


DRAGEN甲基化分析流程
DRAGEN甲基化分析流程提供多种操作模式,包括参考比对和注释辅助模?#20581;?/p>


DRAGEN虚拟长读长检测流程
DRAGEN虚拟长读长(VLRD)检测流程可以在大片段基因组?#23545;?#21306;域有效识别变异,除此之外只能通过长读长测序才能识别。


DRAGEN 定位和比对流程
DRAGEN 定位和比对流程可以极速完成外显子组和基因组的DNA或RNA的定位和比对操作。


GATK最佳实践流程
GATK最佳实践流程是Broad?#33455;?#25152;的开源GATK4.0单倍型变异检测功能在DRAGEN上的一个更为高效的版本。


文献
优惠

更多优惠信息请致电:400-808-2960

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